mirror of
https://github.com/MillironX/nf-configs.git
synced 2024-11-13 05:03:10 +00:00
Merge pull request #3 from ilight1542/mpcdf_eager_config_update
modified mpcdf configs (general + eager)
This commit is contained in:
commit
18890fc3cf
2 changed files with 56 additions and 1 deletions
|
@ -47,7 +47,7 @@ profiles {
|
||||||
}
|
}
|
||||||
|
|
||||||
executor {
|
executor {
|
||||||
queueSize = 8
|
queueSize = 30
|
||||||
pollInterval = '1 min'
|
pollInterval = '1 min'
|
||||||
queueStatInterval = '5 min'
|
queueStatInterval = '5 min'
|
||||||
}
|
}
|
||||||
|
|
|
@ -61,4 +61,59 @@ process {
|
||||||
}
|
}
|
||||||
}
|
}
|
||||||
}
|
}
|
||||||
|
raven {
|
||||||
|
// Specific nf-core/eager process configuration
|
||||||
|
process {
|
||||||
|
|
||||||
|
withName: malt {
|
||||||
|
maxRetries = 1
|
||||||
|
memory = 2048.GB
|
||||||
|
cpus = 72
|
||||||
|
time = 24.h
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
withLabel:'sc_tiny'{
|
||||||
|
cpus = { check_max( 1, 'cpus' ) }
|
||||||
|
memory = { check_max( 1.GB * task.attempt, 'memory' ) }
|
||||||
|
time = 24.h
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
withLabel:'sc_small'{
|
||||||
|
cpus = { check_max( 1, 'cpus' ) }
|
||||||
|
memory = { check_max( 4.GB * task.attempt, 'memory' ) }
|
||||||
|
time = 24.h
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
withLabel:'sc_medium'{
|
||||||
|
cpus = { check_max( 1, 'cpus' ) }
|
||||||
|
memory = { check_max( 8.GB * task.attempt, 'memory' ) }
|
||||||
|
time = 24.h
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
withLabel:'mc_small'{
|
||||||
|
cpus = { check_max( 2 * task.attempt, 'cpus' ) }
|
||||||
|
memory = { check_max( 4.GB * task.attempt, 'memory' ) }
|
||||||
|
time = 24.h
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
withLabel:'mc_medium' {
|
||||||
|
cpus = { check_max( 4 * task.attempt, 'cpus' ) }
|
||||||
|
memory = { check_max( 8.GB * task.attempt, 'memory' ) }
|
||||||
|
time = 24.h
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
withLabel:'mc_large'{
|
||||||
|
cpus = { check_max( 8 * task.attempt, 'cpus' ) }
|
||||||
|
memory = { check_max( 16.GB * task.attempt, 'memory' ) }
|
||||||
|
time = 24.h
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
withLabel:'mc_huge'{
|
||||||
|
cpus = { check_max( 72, 'cpus' ) }
|
||||||
|
memory = { check_max( 240.GB * task.attempt, 'memory' ) }
|
||||||
|
time = 24.h
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
}
|
}
|
||||||
|
|
Loading…
Reference in a new issue