- name: minimap2 align test_minimap2_align_single_end
  command: nextflow run tests/modules/minimap2/align -entry test_minimap2_align_single_end -c tests/config/nextflow.config
  tags:
    - minimap2
    - minimap2/align
  files:
    - path: output/minimap2/test.bam
    - path: output/minimap2/versions.yml

- name: minimap2 align test_minimap2_align_paired_end
  command: nextflow run tests/modules/minimap2/align -entry test_minimap2_align_paired_end -c tests/config/nextflow.config
  tags:
    - minimap2
    - minimap2/align
  files:
    - path: output/minimap2/test.bam
    - path: output/minimap2/versions.yml