nf-core_modules/modules/gatk4
2022-02-04 09:53:32 +01:00
..
applybqsr Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00
applyvqsr Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00
baserecalibrator Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00
bedtointervallist Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00
calculatecontamination Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00
createsequencedictionary Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00
createsomaticpanelofnormals Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00
estimatelibrarycomplexity Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00
fastqtosam Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00
filtermutectcalls Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00
gatherbqsrreports Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00
genomicsdbimport Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00
genotypegvcfs Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00
getpileupsummaries Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00
haplotypecaller Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00
indexfeaturefile Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00
intervallisttools Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00
learnreadorientationmodel Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00
markduplicates Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00
mergebamalignment Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00
mergevcfs Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00
mutect2 Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00
revertsam Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00
samtofastq Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00
splitncigarreads Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00
variantfiltration Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00
variantrecalibrator Add when: block (#1261) 2022-02-04 09:53:32 +01:00